简单可行的SeruatV4的安装方案

目前Seurat的版本从V4升级到了V5,由于一些变化,导致当年取巧,使用@获取数据的方法都无法在V5中使用。

建议在操作前重启下Rstudio(或更确切的说是R)!!!

那么如何确保自己能够安装V4的Seurat呢?

首先,我们需要先安装V5版本,让他帮我把一系列的依赖问题都给解决掉

install.packages('Seurat')
# 检查版本
# packageVersion("Seurat")
# [1] ‘5.0.0’

接着,过河拆桥,把V5版本的Seurat和SeuratObject卸载掉

remove.packages(c("Seurat","SeuratObject"))

然后,我们去安装V4的Seurat,这里要指定repos。

install.packages('Seurat', repos = c('https://satijalab.r-universe.dev'))
# 检查版本
# packageVersion("Seurat")
# [1] ‘4.4.0’

该方法在Windows,Linux服务器,M芯片的Mac中中都测试过(其中Linux的Seurat需要编译)。

Image

稍微进阶一些,我们也不需要卸载V5,也可以做到使用V4,只需要在安装的时候,指定一个新的安装路径

dir.create("~/SeuratV4")
# 然后安装的时候,指定安装目录
install.packages('Seurat', repos = c('https://satijalab.r-universe.dev'), lib = "~/SeuratV4")

在使用的时候,.libPaths配置好路径,使得library加载的时候,能够先加载到V4。

.libPaths(c("~/SeuratV4", .libPaths()))
library(Seurat)> packageVersion("Seurat")
[1] ‘4.3.0’

你学会了吗

 

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.rhkb.cn/news/209442.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系长河编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

【字符串匹配】【KMP算法】Leetcode 28 找出字符串中第一个匹配项的下标☆

【字符串匹配】【KMP算法】Leetcode 28 找出字符串中第一个匹配项的下标 (1)前缀和后缀(2)前缀表(最长相同的前缀和后缀的长度)(3)匹配过程示意(4)next数组的…

matlab 点云放缩变换

目录 一、算法原理二、代码实现三、结果展示四、相关链接本文由CSDN点云侠原创,原文链接。爬虫网站自重。如果你不是在点云侠的博客中看到该文章,那么此处便是不要脸的爬虫与GPT。 一、算法原理 缩放可以独立应用于三个坐标轴,如将点 ( x , y , z ) ( x

[LeetCode周赛复盘] 第 374 场周赛20231203

[LeetCode周赛复盘] 第 374 场周赛20231203 一、本周周赛总结100144. 找出峰值1. 题目描述2. 思路分析3. 代码实现 100153. 需要添加的硬币的最小数量1. 题目描述2. 思路分析3. 代码实现 100145. 统计完全子字符串1. 题目描述2. 思路分析3. 代码实现 100146. 统计感冒序列的数…

使用Linux docker方式快速安装Plik并结合内网穿透实现公网访问

文章目录 1. Docker部署Plik2. 本地访问Plik3. Linux安装Cpolar4. 配置Plik公网地址5. 远程访问Plik6. 固定Plik公网地址7. 固定地址访问Plik 本文介绍如何使用Linux docker方式快速安装Plik并且结合Cpolar内网穿透工具实现远程访问,实现随时随地在任意设备上传或者…

C语言扫雷游戏

提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档 文章目录 前言一、扫雷游戏的分析和设计1.1扫雷游戏的功能说明1.2数据结构的分析1.3文件结构设计 二、扫雷游戏的代码实现总结 前言 详细介绍扫雷游戏的思路和实现过程。 一…

高校人员信息管理系统C++

代码:https://mbd.pub/o/bread/ZZeZk5lx 一、基本内容论述 1、问题描述 某高校有四类员工:教师、实验员、行政人员、教师兼行政人员;共有的信息包括:编号、姓名、性别、年龄等。其中,教师还包含的信息有:所…

堆排序(C语言)

前言 在上一篇内容:大小堆的实现(C语言),我们实现了关于创建大小堆的各函数与实现。但是如果突然要使用一个堆排序但是此时并没有一个现成的堆,这就需要花费时间去新建实现堆的插入删除这些操作从而实现一个堆&#xf…

51单片机应用从零开始(十)·指针

指针 C语言指针是一种保存变量地址的数据类型。它可以让程序直接访问内存中的数据,而不需要通过变量名来访问。指针变量存储的是一个地址,这个地址指向内存中的某个位置,该位置存储了一个值。 在C语言中,可以使用&运算符取得一…

Endnote加入新的style(参考文献格式)

1. 下载模板 可以从官网上下载模板,比如某些常见的期刊都有自己的模板,还有写中文论文的话有专门的GBT7714。 2. 示范 以下图MDPI为例,下载下来是一个ens文件。 双击打开此文件 file -> save as 输入保存的名字,我这里保…

字符串转换整数

字符串转换整数 描述 : 请你来实现一个 myAtoi(string s) 函数,使其能将字符串转换成一个 32 位有符号整数(类似 C/C 中的 atoi 函数)。 函数 myAtoi(string s) 的算法如下: 读入字符串并丢弃无用的前导空格检查下一个字符&am…

Linux:docker镜像的创建(5)

1.基于已有镜像创建 步骤: 1.将原始镜像加入容器并运行 2.在原始镜像中部署各种服务 3.退出容器 4.使用下面命令将容器生成新的镜像 现在我们在这个容器里做了一些配置,我们要把他做成自己镜像 docker commit -m "centos7_123" -a "tarr…

【工具使用-Audition】如何使用Audition查看频率

一,简介 在工作过程中要对处理后的音频进行频率分析,本文以Audition 2020为例进行说明,供参考。 二,操作步骤 2.1 生成测试音源 使用Audition生成左通道为1KHz,右通道为10KHz的音源信号 如图所示: 2.…

Android Init系统:引领设备启动的先锋

Android Init系统:引领设备启动的先锋 引言 Init系统是一个操作系统启动的必要组件,负责在启动时初始化所有系统资源、服务和应用程序。在Android设备中,Init系统起到了至关重要的作用,它是启动过程中的第一个进程,负…

学习知识回顾随笔(远程连接MySQL|远程访问Django|HTTP协议|Web框架)

文章目录 如何远程连接MySQL数据库1.创建用户来运行,此用户从任何主机连接到mysql数据库2.使用IP地址来访问MySQL数据库 如何远程访问Django项目Web应用什么是Web应用应用程序的两种模式Web应用程序的优缺点 HTTP协议(超文本传输协议)简介HTT…

C++-模板

目录 一.泛型编程 二.模板的分类 三.函数模板 1.函数模板的概念 2.函数模板格式 3.函数模板的原理 4.函数模板的实例化 a.隐式实例化 b.显式实例化 5.模板参数的匹配原则 四.类模板 1.类模板的定义格式 2.类模板的实例化 五.class和typename的区别 六.非类型模板…

路由策略,gRPC 路由如何实现

目录 一、为啥我们要路由策略: 二、基于gRPC 路由策略 一、为啥我们要路由策略: 我们可以重新回到调用方发起 RPC 调用的流程。在 RPC 发起真实请求的时候,有一个步骤就是从服务提供方节点集合里面选择一个合适的节点(就是我们…

C++基础 -37- 模板函数与普通函数调用规则

当模板函数比普通函数更好匹配形参的时候&#xff0c;会优先调用模板函数 #include "iostream"using namespace std;template <class T> void show(T a, T b) {cout << a << endl;cout << b << endl;cout << "temp show&…

Matlab论文插图绘制模板第129期—函数网格曲面图

在之前的文章中&#xff0c;分享了Matlab函数折线图的绘制模板&#xff1a; 函数三维折线图&#xff1a; 进一步&#xff0c;再来分享一下函数网格曲面图。 先来看一下成品效果&#xff1a; 特别提示&#xff1a;本期内容『数据代码』已上传资源群中&#xff0c;加群的朋友请自…

Unity DOTS《群体战斗弹幕游戏》核心技术分析之3D角色动画

最近DOTS发布了正式的版本, 我们来分享现在流行基于群体战斗的弹幕类游戏&#xff0c;实现的核心原理。今天给大家介绍大规模战斗群体3D角色的动画如何来实现。 DOTS 对角色动画支持的局限性 截止到Unity DOTS发布的版本1.0.16,目前还是无法很好的支持3D角色动画。在DOTS 的b…

陷同质化“高端”悖论,良品铺子降价应对,沃隆食品IPO已终止

撰稿|行星 来源|贝多财经 坚持“高端零食”战略多年的良品铺子&#xff0c;脱下了自己的“长衫”。 近日&#xff0c;良品铺子&#xff08;SH.603719&#xff09;仅上任三天的董事长、总经理杨银芬在全员公开信中表示&#xff0c;该品牌将实施17年来最大规模降价&#xff0c…