差异表达基因分析[转载]

转自：https://wenku.baidu.com/view/2532ab5176c66137ef06191a.html 

1.转录组

2.转录组研究重要性

3.转录组研究技术

3.1三种的比较

3.2技术比较

4.高通量测序技术的应用

5.转录组数据分析

6.差异表达基因分析

4.1FC法——差异表达倍数法

那么也就是说A与B是2倍的关系。

4.2卡方检验

7.假设检验存在的问题

7.1 t检验差异基因

我终于知道是怎么进行t检验找差异表达基因了，应该是聚类之后单细胞被确定为不同的细胞类型，那么将这些细胞类型子集中的每一个基因表达抽取出来，对每一个基因来说都能够形成一个向量，都会做一次假设检验；那么比如说有5种细胞类型，那么就第一组作为x1，其他4种分别作为x2，这样去做t检验，判断是否是差异表达基因。

7.2方差分析

8.趋势性上调或者下调

我的理解是，在判断差异基因的时候，调整FC的阈值，胡总和是相关系数的阈值，这样就会有得到更多或者更少的差异表达基因。

9.GO分析