================================
分享一个通过 VMD 可计算分子动力学模拟中氢键密度和强度的一维和二维分布程序 HBCalculator。
感谢论文的原作者！
主要内容
“氢键是分子系统中关键的非共价相互作用，对生物、化学和能量相关过程产生重大影响；因此，描述氢键信息对基础研究具有重要意义。这项工作介绍了 HBCalculator，这是一种基于 Tcl 的工具，与 VMD 集成，用于计算氢键密度和强度的一维和二维分布。通过在 MD 模拟中使用 HBCalculator，对纤维素/水和石墨烯/水界面的三个系统进行了测试，以展示其功能。一维和二维氢键分布揭示了界面特性，反映了材料疏水性的影响。”——取自文章摘要。
Figure 1
Figure 2
Figure 3
Figure 4
================================
以上是我们分享的一些经验或者文章的搬运，或有不足，欢迎大家指出！
如有侵权，请联系我立马删除！
详细内容（文章题目、文章链接、附件下载）可在微 信 公 众 号：原子与分子模拟获取，欢迎大家关注。
