医学AI公开课·第一期|Machine LearningTransformers in Med AI

小罗碎碎念

从这周开始,我计划每个周末录一个视频,分享一些医学人工智能领域的进展。

作为第一期视频,我打算介绍一下机器学习和Transformer在医学AI领域中的应用

为了准备这期视频,总共做了24页PPT(三部分内容),直接涉及7篇文献。这个视频总时长33分钟左右,没有办法一一展开介绍各部分的内容,所以我把PPT中涉及到的文献原文都总结好了,会全部上传到知识星球中

另外,也需要和大家说一声抱歉,录频的时候忘记切换副屏了,同时显示了两页PPT画面,下周的视频我会注意的,大家感兴趣可以去知识星球获取本期PPT的pdf版本。


视频链接(B站)

【医学AI公开课·第一期|Machine Learning&Transformers in Med AI】 https://www.bilibili.com/video/BV1XtB2Y9Enx/?share_source=copy_web&vd_source=5f0b6b9556d7893161d47bef9d58c9f2


一、人工智能发展进程

  • 人工智能的诞生(1956)
  • 早期人工神经网络(1940 - 1960年代)
  • 卷积神经网络CNN(1987-1989年)
  • 残差网络ResNet(2015年)
  • UNet(2015年)+nnU-Net(2018年)
  • Transformers(2017年至今)

二、机器学习在医学AI中的应用

  • 肺癌影像组学的应用与挑战
  • 放射组学(radiomics)的工作流程

在这里推荐一本田捷老师主编的影像组学入门书籍,pdf版本已经上传到知识星球了,感兴趣的老师/同学自取。

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  • 放射组学研究中用于临床预测的不同方法
  • 放射组学在结节恶性分类中的应用
  • 放射组学在组织学亚型分类中的研究
  • 深度学习在基因突变预测中的研究情况

这一部分我在后续的病理组学中也提到了,大家可以留意一下

  • 肺癌放射组学研究中常用的Python软件包

三、Transformers在医学AI中的应用

  • 计算病理学中的Vision Transformer应用与挑战
  • 病理AI研究背景

这一张PPT很有意思,因为我在右侧列出了目前病理AI中常用的GPU参数,大家可以收藏参考一下。

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  • 自注意力(Self-Attention,SA)机制
  • 视觉Transformer(Vision Transformer,ViT)的设计
  • 视觉Transformer(ViT)在计算病理学领域应用的概览
  • 基于基因引导的共注意力Transformer模型

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