容器资料
Docker和Singularity
Docker比较适合测试: 环境适配,每种环境对应一个容器。Docker需要host宿主机上运行Docker服务(root权限),隔离性很高,但会牺牲性能,对GPU环境支持不好(需要安装NVIDIAN公司的插件才能把GPU暴露给container)
Sigularity可认为专为HPC环境开发的容器工具,提供对MPICH和OpenMPI并行开发支持,提供对GPU支持,几乎无性能损失。一个打包的应用镜像,到处部署使用。
网络资料
- Running Intel® MPI Library in Containers
- PITT: Singularity Containers
- Singularity Doc 3.5
- Singularity: GPU Support (NVIDIA CUDA & AMD ROCm)
- Singularity: MPI支持
- Singularity-tutorial.github.io
- Introduction to containers and Singularity
- singularity和docker的安装使用
- singularity 安装与使用
- Singularity——生信流程搭建的新宠儿
- Github: Singularity/apptainer
- NASA: Singularity使用
- UL HPC Tutorial: HPC Containers with Singularity
- Singularity 容器使用介绍