LabVIEW双光子荧光显微成像系统开发

双光子显微成像是一种高级荧光显微技术,广泛用于生物学和医学研究,尤其是用于活体组织的深层成像。在双光子成像过程中,振镜(Galvo镜)扮演了非常关键的角色,它负责精确控制激光束在样本上的扫描路径。以下是双光子成像实验的基本流程,以及各硬件的功能和它们如何协同工作来实现成像。

实验流程和硬件功能

  1. 激光源:

    • 双光子成像需要使用特定波长的激光,通常是近红外激光,因为它能深入组织且对生物样本的损伤较小。

    • 激光通过调制设备(如电光调制器EOM)进行强度调制,以控制照射到样本上的光量。

  2. 振镜(Galvo镜)系统:

    • 振镜系统包括X轴和Y轴两个振镜,负责在水平和垂直方向上快速、精确地移动激光束。

    • 振镜接收来自控制系统(如计算机通过数据采集卡DAQ发送的电压信号),这些信号转换为镜子的物理倾斜,以便于激光扫描整个视野或特定区域。

  3. 物镜:

    • 物镜聚焦激光束到样本上的一个微小点,并收集样本发出的荧光信号。

    • 对于深度成像,物镜的数值孔径(NA)和工作距离是重要参数。

  4. 探测器:

    • 探测器(通常是光电倍增管PMT或雪崩光电二极管APD)用于收集样本发出的荧光,并将光信号转换为电信号。

    • 在双光子成像中,由于荧光信号弱,探测器的灵敏度和信噪比非常关键。

  5. 数据采集和图像构建:

    • 数据采集系统(DAQ)同步控制振镜的移动和探测器的信号采集。

    • 计算机接收到的信号经过处理后,根据振镜的扫描路径重构成图像。

实验操作逻辑和实现

  1. 实验准备:

    • 选择合适的物镜和激光波长,准备好生物样本,并将样本置于显微镜台上。

  2. 设置扫描参数:

    • 通过软件(如ScanImage)设置扫描范围、扫描速度、像素分辨率等参数。

    • 调整激光功率和探测器增益,以获得最佳的图像质量和信噪比。

  3. 启动扫描:

    • 软件控制激光器启动,并通过DAQ向振镜发送电压信号,开始扫描过程。

    • 振镜按照预设的模式快速移动激光束,同时探测器同步收集从样本发出的荧光。

  4. 图像重构和分析:

    • 收集到的信号数据根据扫描路径被重构成图像。

    • 用户可以通过软件进行图像后处理,如对比度调整、3D重建、定量分析等。

  5. 深度成像:

    • 对于深层组织成像,可以通过改变物镜的焦距(使用Fast Z扫描)来获得不同深度的图像,从而构建三维图像。

双光子成像实验需要精密的硬件控制和高速数据处理。振镜系统的高速、精确控制是实现高分辨率成像的关键。整个过程通过软件集成,用户可以灵活设置实验参数,以适应不同的研究需求。

LabVIEW双光子荧光显微成像系统开发

双光子荧光显微镜扫描控制与成像系统是一个高端的生物医学成像技术,它结合了精密的光学、电子和计算技术来实现活体内部深层组织的高分辨率成像。本部分旨在详细解析这一系统的工作原理,包括双光子荧光原理、激光扫描控制技术、信号检测与图像重建方法等关键技术。

双光子荧光原理

双光子荧光显微镜技术基于双光子吸收效应,这是一种非线性光学现象。当两个光子几乎同时(在10^-15秒的时间窗内)击中染料分子,它们可以被同时吸收,使分子从基态跃迁到激发态。这种跃迁需要的光子能量是单光子吸收的两倍,但每个光子的能量只有单光子吸收所需能量的一半。因此,双光子吸收通常使用近红外激光,这样的光波长较长,能量较低,对生物样本的损伤小,并且能更深入地穿透生物组织。

激光扫描控制技术

双光子荧光显微镜的成像系统依赖于精确控制激光束在样品上的扫描。通常采用振镜(galvanometer-based mirrors)对激光束进行快速、精确的偏转,实现对样品的二维扫描。同时,通过改变激光焦点在样品内部的深度(z轴调整),可以获得样品的三维图像。这种扫描方式要求激光扫描系统和样品移动平台(如XYZ三维位移台)之间的精确同步控制,以及高速、高精度的数据采集和处理能力。

信号检测与图像重建

在双光子吸收发生后,激发态的分子会释放出荧光,回到基态。这些荧光信号被光电倍增管(PMT)等检测器捕获。由于双光子吸收的非线性特性,荧光产生的位置非常局限,这就使得成像具有很高的空间分辨率。收集到的荧光信号随后被转换为电信号,通过数据采集系统传输给计算机。

计算机中的成像软件,如LabVIEW开发的专门应用程序,负责对这些信号进行处理和图像重建。这包括信号的放大、滤波、去噪等预处理步骤,以及将收集到的点扫描数据组装成二维或三维图像。图像重建过程还可能包括对图像的进一步增强和分析,如对比度调整、伪色彩添加、三维重建等。

软件设计

用户界面设计

LabVIEW的用户界面,也称为前面板,提供了直观的图形操作界面,使得操作人员可以轻松地进行实验设置、监控实验过程和查看实验结果。在双光子显微系统中,前面板设计包括但不限于:

参数输入区,用于设置扫描速度、激光功率、采集时间等关键实验参数。

控制按钮,如“开始”、“停止”扫描、“保存数据”等。

实时显示区,用于显示扫描过程中的实时图像或数据波形。

结果显示区,展示最终的成像结果或数据分析结果。

系统控制逻辑

LabVIEW的块图是其程序设计的核心,使用图形化的编程语言(G语言)来实现。在双光子显微系统中,控制逻辑主要实现以下功能:

激光器控制,包括功率调整和波长选择。

扫描系统控制,精确控制激光束的扫描路径和速度。

数据采集系统控制,同步收集光电倍增管(PMT)的信号。

信号处理与图像重建,对采集到的信号进行处理,生成高质量的图像。

信号处理与图像重建

LabVIEW提供了丰富的信号处理和图像处理工具箱,支持对采集到的数据进行预处理、滤波、去噪等操作,以及完成从原始数据到最终图像的转换。具体步骤包括:

信号放大和数字化,将PMT的模拟信号转换为数字信号。

信号预处理,包括基线校正、滤波等,以提高信号质量。

图像重建,根据扫描路径和采集到的信号重建图像。

开发流程与实现

硬件与软件的集成

LabVIEW支持与多种硬件接口通信,包括GPIB、串口、USB、以太网等,这使得它能够轻松地与激光器、扫描控制器、数据采集卡等硬件集成。开发过程中,首先需要通过适当的接口与硬件连接,然后使用LabVIEW提供的驱动程序或API函数来实现对硬件的控制。

软件逻辑开发

开发人员需要使用LabVIEW的块图环境来设计系统的控制逻辑和数据处理流程。这通常涉及到循环结构(用于实现扫描控制)、条件结构(用于实现参数设置和控制决策)以及数据结构(用于存储和处理采集到的数据)。

调试与优化

LabVIEW提供了强大的调试工具,包括探针、执行高亮显示、单步执行等,这些工具帮助开发人员诊断和解决程序中的错误。此外,性能优化也是开发过程中的一个重要方面,包括代码优化、内存管理和并行处理等,以确保系统运行的高效和稳定。

LabVIEW在双光子荧光显微镜扫描控制与成像系统中的应用展示了其作为一个强大的图形化编程环境在科学研究和工程应用中的潜力。通过LabVIEW,复杂的控制逻辑和数据处理流程得以直观地实现,大大加快了开发进程,提高了系统的可靠性和用户的操作便利性。随着技术的进步,LabVIEW将继续在更多领域发挥其关键作用。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.rhkb.cn/news/253758.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系长河编程网进行投诉反馈email:809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

贪心算法篇

“靠漫步,将生趣填饱~” 贪心算法简介? 贪心算法(Greedy Algorithm),也称为贪婪算法,是一种在解决问题时采取贪心策略的方法。其基本原理是很简单的: “在每个决策点上都选择当下看似最好的选项…

専攻春节钜惠

専攻春节钜惠 大家好,新春佳节到来之际,为了答谢大家多年来的支持厚爱,也为了更广泛的推广VBA应用,“VBA语言専攻”在春节期间再次推出钜惠活动,时间2月9日到2月17日(大年三十到正月初八) 1 &…

一个基于 .NET 7 + Vue.js 的前后端分离的通用后台管理系统框架 - DncZeus

前言 今天给大家推荐一个基于.NET 7 Vue.js(iview-admin) 的前后端分离的通用后台权限(页面访问、操作按钮控制)管理系统框架:DncZeus。 官方项目简介 DncZeus是一个基于 .NET 7 Vue.js 的前后端分离的通用后台管理系统框架。后端使用.NET 7 Entity Framework…

6-3、T型加减速单片机程序【51单片机+L298N步进电机系列教程】

↑↑↑点击上方【目录】,查看本系列全部文章 摘要:根据前两节内容,已完成所有计算工作,本节内容介绍具体单片机程序流程及代码 一、程序流程图 根据前两节文章内容可知,T型加减速的关键内容是运动类型的判断以及定时…

第5节、S曲线加减速转动【51单片机+L298N步进电机系列教程】

↑↑↑点击上方【目录】,查看本系列全部文章 摘要:本节介绍步进电机S曲线相关内容,总共分四个小节讨论步进电机S曲线相关内容 5-1、S曲线加减速简介   根据上节内容,步进电机每一段的速度可以任意设置,但是每一段的…

单片机学习笔记---中断系统(含外部中断)

目录 中断介绍 中断优先级 中断嵌套 中断技术的优点 中断的结构 中断请求源 中断优先级 5个基本中断内部的结构 INT0和INT1 T0和T1 串口 中断寄存器 IE TCON 中断优先级列表 中断号 中断响应的条件 代码编写实例分析 外部中断硬件电路分析 这一节我们主要是…

视频上传 - 断点续传那点事

在上一篇文章中,我们讲解了分片上传的实现方式。在讲解断点续传之前,我要把上篇文章中留下的问题讲解一下。读过上一篇文章的小伙伴们都知道,对于分片上传来说,它的传输方式分为2种,一种是按顺序传输,一种是…

GPT-1, GPT-2, GPT-3, GPT-3.5, GPT-4论文内容解读

目录 1 ChatGPT概述1.1 what is chatGPT1.2 How does ChatGPT work1.3 The applications of ChatGPT1.3 The limitations of ChatGPT 2 算法原理2.1 GPT-12.1.1 Unsupervised pre-training2.1.2 Supervised fine-tuning2.1.3 语料2.1.4 分析 2.2 GPT-22.3 GPT-32.4 InstructGPT…

【操作系统】MacOS虚拟内存统计指标

目录 命令及其结果 参数解读 有趣的实验 在 macOS 系统中,虚拟内存统计指标提供了对系统内存使用情况和虚拟内存操作的重要洞察。通过分析这些指标,我们可以更好地了解系统的性能状况和内存管理情况。 命令及其结果 >>> vm_stat Mach Virtu…

常见云计算服务模式( IaaS基础架构即服务、PaaS平台即服务、SaaS软件即服务)

常见云计算服务模式 ( IaaS基础架构即服务、PaaS平台即服务、SaaS软件即服务) 零、00时光宝盒 世界并不完美,面对很多事情我们都很无奈甚至悲哀,但生活总要继续下去,不止是为了自己。抱怨没有用,顾影自怜也…

51单片机之LED灯模块篇

御风以翔 破浪以飏 🎥个人主页 🔥个人专栏 目录 点亮一盏LED灯 LED的组成原理 LED的硬件模型 点亮一盏LED灯的程序设计 LED灯闪烁 LED流水灯 独立按键控制LED灯亮灭 独立按键的组成原理 独立按键的硬件模型 独立按键控制LED灯状态 按键的抖动 独立按键…

Python(SQLite)executescript用法

SQLite 数据库模块的游标对象还包含了一个 executescript() 方法,这不是一个标准的 API 方法,这意味着在其他数据库 API 模块中可能没有这个方法。但是这个方法却很实用,它可以执行一段 SQL 脚本。 例如,如下程序使用 executescr…

Android中的MVVM

演变 开发常用的框架包括MVC、MVP和本文的MVVM,三种框架都是为了分离ui界面和处理逻辑而出现的框架模式。mvp、mvvm都由mvc演化而来,他们不属于某种语言的框架,当存在ui页面和逻辑代码时,我们就可以使用这三种模式。 model和vie…

uniapp android和微信小程序实现PDF在线预览

在使用uniapp开发移动端时,微信开发者工具里webview能正常打开后端接口返回的pdf文件流。正式发布后,在配置了业务域名和服务器域名的前提下,预览pdf文件却只能看到白屏,因此我猜测微信小程序不能通过webview读取文件流。这个想法…

机器学习的整个流程

机器学习的整个流程定义了数据科学团队执行以创建和交付机器学习模型的工作流。此外,机器学习流程还定义了团队如何协作合作,以创建最有用的预测模型。 机器学习high level的流程 机器学习流程的关键步骤包括问题探索(Problem Exploration&a…

Django模板(三)

一、标签URL 返回与给定视图和可选参数相匹配的绝对路径引用(不含域名的 URL) {% url some-url-name v1 v2 %} 第一个参数是url模式名称,后面跟着的是参数,以空格分隔可以使用关键字: {% url some-url-name arg1=v1 arg2=v2 %}如果您想检索命名空间的URL,请指定完全限定…

探讨CSDN等级制度:博客等级、原力等级、创作者等级

个人名片: 🦁作者简介:学生 🐯个人主页:妄北y 🐧个人QQ:2061314755 🐻个人邮箱:2061314755qq.com 🦉个人WeChat:Vir2021GKBS 🐼本文由…

Ansible command命令模块 这个模块可以直接在远程主机上执行命令,并将结果返回本主机。

目录 参数介绍练习环境配置主机清单配置无密码链接ping模块 command 命令模块也可以用来安装点东西看个路径 command 指定目录来 指定命令 参数介绍 chdir    # 在执行命令之前,先切换到该目录 executable # 切换shell来执行命令,需要使用命令的绝对…

机器学习数学基础

机器学习基础 1、标量、向量、矩阵、张量2、概率函数、概率分布、概率密度、分布函数3、向量的线性相关性4、最大似然估计5、正态分布(高斯分布)6、向量的外积(叉积)7、向量的内积(点积)8、超平面(Hyperplane)9、广义线性模型(GLM)10、伯努利分布与二项分布11、凸函数…

Java基于微信小程序的驾校报名小程序,附源码

博主介绍:✌程序员徐师兄、7年大厂程序员经历。全网粉丝12w、csdn博客专家、掘金/华为云/阿里云/InfoQ等平台优质作者、专注于Java技术领域和毕业项目实战✌ 🍅文末获取源码联系🍅 👇🏻 精彩专栏推荐订阅👇…