一、问题阐述
package ‘Seurat’ was built under R version 4.3.3Loading required package: SeuratObject Error: This is R 4.0.4, package ‘SeuratObject’ needs >= 4.1.0
当你在rstudio中出现这样的报错时,意味着你需要更新你的R 的版本了。
二、解决方法
1.提前准备好conda的R单独环境
conda env list #查看已有环境
conda create -n R4.3.3
conda activate R4.3.3
发现原来已经有安装过R ,只是R的版本过低了。
小问题,我们重新安装即可。
2. 进入环境后,多添加一些conda channel
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
conda config --show
channel少的话,r-base种类少
conda search r-base
3.选择一款适合的版本
不能说要最新的版本,看是否合适。
我选的是4.3.3版本的。
conda install r-base=4.3.3
which -a R
将自己刚才安装的R绝对路径添加到.bashrc中的环境变量中$PATH,也可以加alias。