如何在python中读取matlab输出的.mat文件

写在前面

经常会使用matlab处理数据，比如之前在进行空间滤波发现matlab自带的空间滤波函数。但是，由于后续使用python绘图更熟练一点，所以涉及到在python中读取matlab输出的文件，一般以.mat文件为主。下面测试了几种读取方式，选了一个比较好用的方式。

这里简单将读取的.mat文件分为两种数据类型：

1、array数组(如网格数据)
2、str字符串列表(如网页链接)

对于数组的读取

scipy.io.loadmat

对于一般的数组，可以通过scipy库的相关函数包进行读取，命令如下：


import scipy.io as siof = sio.loadmat(r'I:\data.mat')print(f.keys())data=f['MASK']

将mat文件中的变量的名称进行打印并进行读取，比如我这里的变量名称为：MASK,这样得到的数据data就是标准存储的数组格式

mat4py.loadmat

安装方式：

conda / pip install mat4py

这里也可以通过mat4py包的相关函数进行读取，读取相同的数据，得到的数据类型为：list-列表或者是dict-字典


from mat4py import loadmatf = loadmat(r'I:\data.mat')['MASK']

但是感觉不如直接用scipy的好用

mat73.loadmat

安装方式：

conda / pip install mat73

读取方式：


import mat73f = mat73.loadmat(r'I:\data.mat')

这也是一种读取方式，但是会受限于matlab的版本，比如说我这里使用读取上面相同的数据，就会报错提示

TypeError: I:\data.mat is not a MATLAB 7.3 file. Load with scipy.io.loadmat() instead.

提醒我们使用scipy.io.loadmat()来读取上述文件

对于字符串的读取

如果你通过matlab报错输出的文件，不是数组而是字符串等等。


import scipy.io as siof = sio.loadmat(r'I:\str.mat')

使用scipy.io.loadmat()会发生以下报错：

NotImplementedError: Please use HDF reader for matlab v7.3 files, e.g. h5py

然后根据他的提示呢，我们可以分别使用刚刚上面提到的mat73.loadmat()或者是h5py


import mat73f= mat73.loadmat(r'I:\str.mat')

h5py

安装h5py:

conda install h5py

这里需要提醒一句的是，如果你使用 pip install h5py，而且你在之前安装过geopandas或者salem，且是在windows环境安装的，需要注意版本的依赖，因为安装h5py时，是会安装相关版本适配的gdal库的；所以我建议你使用 conda install h5py。

读取方式：


import h5pyf = h5py.File(r'I:\str.mat')print(f.keys())

使用下来感觉mat73可以直接将文件中的数值提取出来，相对来说更方面一点。

总结

总体上，比较了对于纯数组array以及纯字符str输出的mat文件在python中的读取方式。
对于array输出的mat文件，推荐使用scipy.io.loadmat(r'./data.mat')进行读取，而对于str输出的mat文件，推荐使用mat73.loadmat(r'./data.mat') 进行读取。
当然，这里也存在一些问题，比如说当输出的mat文件包含多种数据类型时，是否上述两种方式会不适应，下次具体遇到时再具体解决。