科研绘图系列:R语言堆积图(stacked barplot)

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文章目录

    • 介绍
    • 加载R包
    • 导入数据
    • 数据预处理
    • 画图
    • 导出数据
    • 系统信息

介绍

微生物堆积图是一种数据可视化工具,通常用于展示微生物群落中不同物种的相对丰度。这种图表通过将每个样本中的微生物按照其分类学等级(如门、属等)进行分类,并以不同颜色的块状图表示,每个块的大小代表该物种在样本中的相对丰度。堆积图可以堆叠显示,以展示多个样本或样本组中微生物的组成和差异。

微生物堆积图的作用包括:

  1. 展示物种多样性:通过不同颜色的块状图展示不同物种的相对丰度,可以直观地看出哪些物种在群落中占主导地位。
  2. 比较不同样本:可以同时展示多个样本的微生物组成,通过比较不同颜色块的大小和比例,可以分析不同样本间的微生物组成差异。
  3. 分析生态差异:在环境微生物学研究中,堆积图可以用来分析不同环境条件下微生物群落的组成差异,从而揭示环境因素对微生物群落结构的影响。

加载R包

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