CT检查在临床中应用十分广泛,CT以其扫描速度快,对骨头及钙化敏感而具有部分优势。
CTA是CT血管成像,是CT临床应用中一个非常重要的部分,由于血管及其背景软组织自然对比差,常规CT平扫往往难以显示血管。在行CTA检查的时候,需要引入对比剂,改变血管与背景组织的影像对比,从而突显血管。
CTA广泛的应用在头颈部血管、心脏冠状动脉、肺动静脉、胸主动脉、腹主动脉、下肢动静脉中。
其中比较常用的是冠脉CTA及头颈部CTA(经常是配合CTA+CTP一站式解决方案)。
Part1: 实现步骤
在使用 PyQt 和 VTK 进行 CTA(CT 血管造影)血管重建时,通常涉及以下几个步骤:
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加载 CTA 数据:读取 DICOM 格式的 CTA 数据。
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预处理数据:对数据进行预处理,如滤波、降噪等。
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血管分割:使用分割算法(如区域生长、水平集等)提取血管结构。
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三维重建:将分割后的血管数据转换为三维模型。
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可视化:使用 VTK 进行三维可视化,并通过 PyQt 创建用户界面。
以下是一个简单的示例代码,展示如何使用 PyQt 和 VTK 进行 CTA 血管重建和可视化:
Part2:简单实现
import sys
import vtk
from PyQt5 import QtWidgets
from vtk.qt.QVTKRenderWindowInteractor import QVTKRenderWindowInteractorclass CTAVisualization(QtWidgets.QMainWindow):def __init__(self, parent=None):super(CTAVisualization, self).__init__(parent)# 创建 VTK 渲染窗口和交互器self.vtkWidget = QVTKRenderWindowInteractor(self)self.setCentralWidget(self.vtkWidget)# 创建 VTK 渲染器和渲染窗口self.renderer = vtk.vtkRenderer()self.vtkWidget.GetRenderWindow().AddRenderer(self.renderer)# 加载 CTA 数据reader = vtk.vtkDICOMImageReader()reader.SetDirectoryName("path/to/dicom/files")reader.Update()# 预处理数据(例如:高斯滤波)gaussian = vtk.vtkImageGaussianSmooth()gaussian.SetInputConnection(reader.GetOutputPort())gaussian.SetRadiusFactors(1, 1, 1)gaussian.Update()# 血管分割(例如:区域生长)seed = (100, 100, 100) # 种子点坐标segmentation = vtk.vtkImageThresholdConnectivity()segmentation.SetInputConnection(gaussian.GetOutputPort())segmentation.SetSeed(seed)segmentation.ThresholdBetween(100, 200) # 设置阈值范围segmentation.ReplaceInOn()segmentation.SetInValue(255)segmentation.Update()# 三维重建(例如:Marching Cubes)mc = vtk.vtkMarchingCubes()mc.SetInputConnection(segmentation.GetOutputPort())mc.SetValue(0, 128) # 设置等值面值mc.Update()# 创建映射器和演员mapper = vtk.vtkPolyDataMapper()mapper.SetInputConnection(mc.GetOutputPort())actor = vtk.vtkActor()actor.SetMapper(mapper)# 添加到渲染器self.renderer.AddActor(actor)self.renderer.ResetCamera()# 设置背景颜色self.renderer.SetBackground(0.2, 0.3, 0.4)# 初始化交互器self.vtkWidget.Initialize()self.vtkWidget.Start()if __name__ == "__main__":app = QtWidgets.QApplication(sys.argv)window = CTAVisualization()window.show()sys.exit(app.exec_())
Part3:注意事项:
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路径设置:确保
reader.SetDirectoryName("path/to/dicom/files")
中的路径正确指向你的 DICOM 文件目录。 -
种子点选择:区域生长分割需要设置合适的种子点,通常需要根据具体数据调整。
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阈值设置:分割和重建的阈值需要根据具体数据进行调整,以获得最佳效果。
Part4:依赖库:
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PyQt5
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VTK
Part5: 实现效果:
CTA重建:脑血管重建,CT三维重建,三维建模