在Linux中，使用nohup命令结合&来在后台运行java -jar xxx.jar命令时，实际上每个nohup命令都会将其标准输出（stdout）和标准错误输出（stderr）重定向到一个名为nohup.out的文件中，除非你明确指定了不同的输出文件。因此，如果你在同一个目录下执行两个或更多类似的命令，而没有为它们指定不同的输出文件，那么这些命令的输出会写入到同一个nohup.out文件中，这可能会导致输出内容的混淆。

例如，如果你执行以下两个命令：

	nohup java -jar app1.jar &
	nohup java -jar app2.jar &

默认情况下，这两个命令的输出都会写入到当前目录下的nohup.out文件中。

为了避免这种情况，你可以为每个nohup命令指定不同的输出文件。这可以通过重定向nohup命令的输出来实现。例如：

	nohup java -jar app1.jar > app1.out 2>&1 &
	nohup java -jar app2.jar > app2.out 2>&1 &

在这个例子中，>用于将标准输出（stdout）重定向到指定的文件（这里是app1.out和app2.out），而2>&1则用于将标准错误输出（stderr）也重定向到标准输出所指向的同一个文件中。这样，你就可以清晰地分离并管理不同应用程序的输出。

总结一下，使用nohup命令在Linux中运行多个Java应用程序时，如果不指定不同的输出文件，它们的输出会写入到同一个nohup.out文件中，这可能会导致冲突或混淆。为避免这种情况，最好为每个应用程序指定不同的输出文件。