(Xshell 8 + Xftp 8)下载安装miniconda至服务器指定目录+配置虚拟环境

一一一一

Xshell 8 + Xftp 8均已登录,miniconda.sh安装包已经放在服务器指定目录中

二二二二

赋予脚本执行权限

chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

安装miniconda

./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -p /data1/huyan/zhangyifeng/miniconda3

一直Enter(yes)

 查看conda的版本

conda --version

报错

/home/zhangyifeng/miniconda3/bin/conda: No such file or directory

出现这个错误提示表明系统在查找 conda 命令时,还是去默认的 /home/zhangyifeng/miniconda3/bin 路径下找,而不是实际安装的 /data1/huyan/zhangyifeng/miniconda3/bin 路径。需要手动激活conda

source /data1/huyan/zhangyifeng/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh

再查看conda版本

conda --version

上述只能临时解决问题,需要更改.bashrc文件

nano ~/.bashrc

进入另一个界面,在末尾添加两行

export PATH="/data1/huyan/zhangyifeng/miniconda3/bin:$PATH"
source /data1/huyan/zhangyifeng/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh

Ctrl + X,然后按 Y 保存修改,再按 Enter 退出 nano 界面

生效环境变量

source ~/.bashrc
conda --version
conda 25.1.1

三三三三

创建虚拟环境,每个项目需要的安装包不尽相同,可以隔离,方便

conda create -n new_env python=3.8

 激活新环境

conda activate new_env

新建的环境会在miniconda3/envs路径下

四四四四

克隆github项目(需要有git) 将项目复制到带有Python3.x的new_env环境下

cd SurgVLP

 进入到对应的项目就可以安装对应的包之类

pip install -r requirements.txt

五五五五

每个项目依赖独立的Python环境和安装包,使用结束,可以执行命令退出当前环境

conda deactivate

退出服务器重登若出现conda命令失效,可能文件内容消失,需要重新激活,回到nano界面

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