InnoDB选择使用B+树作为其主要的数据结构，主要基于以下几点原因：

一、高效的查询性能

B+树是一种平衡树，所有值都存储在叶子节点，而且叶子节点之间有指针相连。这种结构使得B+树在查询过程中只需进行一次平衡的二分查找，从而保证了较快的查询速度。同时，由于B+树的节点通常较大，可以减少访问节点的次数，进一步提高查询效率。此外，内部节点仅存储键值，这允许在同样的磁盘空间内存储更多的键，进而减少数据查找过程中磁盘I/O的次数。

二、优化的磁盘I/O

B+树的结构使得大部分查询操作能够预测磁盘页面的读取（尽可能地顺序读取），这减少了随机访问磁盘的需要，从而优化了磁盘I/O性能。这对于数据库性能是关键，尤其是在处理大规模数据集时。由于B+树的层数较少，而每层的节点非常多，因此可以尽量减少磁盘I/O操作的次数，提高检索效率。

三、有效的支持范围扫描

B+树的叶子节点之间的链接使得执行范围扫描（如查找在某个值范围内的所有记录）变得非常高效。这是许多数据库查询常见的需求，尤其是在商业分析和报表生成中。一旦找到范围的起始点，可以直接通过链表顺序遍历到终点，而无需重新进行树的查找操作。

四、适合大型数据库

随着数据库大小的增长，B+树的深度相对增长较慢，这保证了即使是非常大的数据库也能保持良好的性能。B+树能够随着数据规模的增长自动调整树的高度，而不会像需要重新调整哈希表的容量那样影响性能。

五、支持高并发和事务

InnoDB存储引擎是一个支持事务的引擎，而B+树索引结构对于并发操作和事务处理非常友好。由于B+树的特性，例如节点间有序的链接和叶子节点包含了完整的数据记录，使得并发访问时可以减少锁的竞争，提高系统的并发性能。

六、保持数据有序性

B+树索引结构保持了数据的有序性，这对于许多应用场景来说非常重要。有序数据的存储和查询可以提高访问效率，并且在某些情况下还能够减少磁盘I/O的次数。

综上所述，InnoDB选择使用B+树作为其主要的数据结构是基于其在查询效率、范围查询支持、并发性能、磁盘I/O优化、适应大型数据库以及保持数据有序性等方面的优势。这些优势使得InnoDB能够在高并发、高性能、事务处理要求较高的数据库应用中表现出色。